De EK2016 organisatie wordt gevoerd door de UEFA Euro 2016 stuurgroep. Deze stuurgroep bestaat uit 4 belangrijke organisatorische belanghebbenden: de UEFA, de Franse Football Federation (FFF), de Franse overheid en de speelsteden. De stuurgroep is een plaats voor discussie en een plaats om informatie te delen over de voortgang van belangrijke projecten in het proces. De stuurgroep is op 21 april 2011 opgezet en ontmoet elkaar 2 of 3 keer per jaar.
De organisatie van het EK2016 bestaat uit de volgende personen:
De speelsteden hebben een gezamenlijke organisatie gevormd, namelijk de Club des Sites (host city association). De voorzitter van deze organisatie is de burgemeester van Bordeaux, de heer Alain Juppé.
De UEFA heeft alle competitierechten van het Europese voetbal. De Franse Football Federation heeft samen met de UEFA een bedrijf opgericht voor de organisatie van het EK2016, genaamd Euro 2016 SAS. In dit bedrijf zijn alle verantwoordelijkheden omtrent de operationele organisatie van het toernooi gedelegeerd. Hierdoor is één enkele organisatie verantwoordelijk voor de hele organisatie van het EK2016.
Euro 2016 SAS is opgericht op grond van de Franse wetgeving. De aandelen zijn voor 95% in bezit van de UEFA en voor de overige 5% in bezit van de Franse Football Federation. Het hoofdkantoor van deze organisatie is in Parijs. Alle uitgaven van de SAS worden gefinancierd door de UEFA. De president van het bedrijf is Jacques Lambert.
De UEFA heeft 2 directe organisatorische opdrachten:
De Franse Football Federation is verantwoordelijk voor de veiligheid rondom de stadions en het vrijwilligersprogramma. Het vrijwilligersprogramma is ook onderdeel van de organisatie door de Franse Football Federation. Op 30 maart 2014 is het vrijwilligersprogramma opgezet.
De Euro 2016 SAS (UEFA en FFF) is verantwoordelijk voor alle andere operationele toewijzingen van opdrachten, zoals de promotie van het evenement, de loting, marketing en managen van rechten en de technische en logistieke organisatie.
De Franse overheid is verantwoordelijk voor de bereikbaarheid van de stadions en overige infrastructuur, de publieke veiligheid, promotie van het land en de speelsteden en verwelkoming van toeristen en supporters.
Het aantal werknemers van de organisatie van het EK2016 neemt toe, naarmate het toernooi dichterbij komt.